После ввода в 1998 году в эксплуатацию пускового комплекса ЗАО «Полигон» на омских предприятиях были закрыты свалки, отвалы и ведомственные полигоны промышленных отходов, не соответствовавшие природоохранным требованиям. Промышленные отходы 3 и 4 класса опасности должны были передаваться для захоронения ЗАО «Полигон». По информации Госкомэкологии, в 1999 году предприятия вывезли лишь 3500 тонн отходов из 14000. Для выяснения причин этого была проведена специальная проверка. Оказалось, что предприятия не выполняли необходимые по природоохранному законодательству и по собственной технологии ремонты и очистки оборудования, что и привело к сокращению объема отходов. Тринадцать руководителей омских предприятий получили предписание Госкомэкологии о необходимости вывезти вредные отходы на полигон. А некоторым из них — о необходимости соблюдения закона напомнила природоохранная прокуратура.